Використання материнського капіталу при будівництві будинку здійснюється у два етапи. Відразу після задоволення заяви на рахунок власника сертифіката надходить половина наявної суми материнського капіталу. Засоби, що залишилися, перераховуються після виконання основних робіт зі зведення або реконструкції будинку.