МРТ проводиться протягом 15-20 хвилин, за цей час комп'ютер аналізує достатню кількість інформації, отриманої внаслідок взаємодії магнітних полів томографа та організму пацієнта. Під час проведення МРТ пацієнт не відчуває жодних неприємних відчуттів.