На підставі численних досліджень в даний час при лікуванні хламідійної інфекції застосовують три основні групи антибіотиків: тетрацикліни, макроліди, фторхінолони. Сульфаніламіди, пеніциліни і цефалоспорини мають низьку активність і можуть сприяти персистуванню інфекції.