В ембріональному періоді розвитку спочатку формується черв'як, як найдавніша частина мозочка, а потім його півкулі. У новонародженого черв'як мозочка виявляється більш розвиненим, ніж півкулі. На 4-5-му місяці внутрішньоутробного розвитку розростаються поверхневі відділи мозочка, утворюються борозни та звивини.